Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SEC23BQ15437 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SEC23BQ15437 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SEC23BQ15437 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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