Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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