Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
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