Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE4AQ14139 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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