Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A3Q14050 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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