Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4AQ13619 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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