Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC1Q13547 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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