Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XRCC4Q13426 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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