Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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PTK7Q13308 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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PTK7Q13308 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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PTK7Q13308 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK7Q13308 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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PTK7Q13308 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK7Q13308 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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