Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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