Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD2Q13200 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD2Q13200 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms