Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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