Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDNQ13061 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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