Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK3Q13003 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms