Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPRL3Q12980 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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NPRL3Q12980 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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NPRL3Q12980 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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NPRL3Q12980 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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NPRL3Q12980 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPRL3Q12980 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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