Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF2Q12947 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF2Q12947 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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