Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 46.95□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SFXN5-217ENST00000485057 447 ntTSL 56.73□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 26.73□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 KDM5A-202ENST00000535014 551 ntTSL 46.47□□□□□ -1.371e-11■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-215ENST00000536145 546 ntTSL 46.38□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 56.36□□□□□ -1.391e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RBMX-205ENST00000496459 2041 ntTSL 26.12□□□□□ -1.432e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 25.95□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 55.95□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-210ENST00000474684 635 ntTSL 35.88□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-212ENST00000559276 554 ntTSL 45.75□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-215ENST00000559771 561 ntTSL 45.75□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-204ENST00000467667 865 ntTSL 35.69□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.519e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-224ENST00000491919 609 ntTSL 35.32□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RALGAPB-209ENST00000632792 4858 ntTSL 55.11□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 KDM5A-204ENST00000536014 558 ntTSL 44.81□□□□□ -1.641e-11■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 EIF2AK3-202ENST00000415570 2902 ntTSL 1 (best)4.78□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.682e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.711e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DCP1A-203ENST00000559748 581 ntTSL 34.35□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-218ENST00000447421 900 ntTSL 54.21□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-203ENST00000409139 519 ntTSL 34.19□□□□□ -1.749e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-203ENST00000430838 2308 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.772e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 23.65□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RPAP2-201ENST00000477322 755 ntTSL 23.61□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-209ENST00000526196 1451 ntTSL 1 (best)3.44□□□□□ -1.862e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-222ENST00000464581 425 ntTSL 23.17□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FBXO11-208ENST00000480038 600 ntTSL 43.13□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SFXN5-216ENST00000484123 351 ntTSL 23.03□□□□□ -1.922e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FBXO11-204ENST00000424163 560 ntTSL 42.72□□□□□ -1.972e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -22e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SOS1-205ENST00000461545 441 ntTSL 32.47□□□□□ -2.012e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.162e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 POLG2-203ENST00000578687 376 ntTSL 21.33□□□□□ -2.22e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PLD1-205ENST00000440204 646 ntTSL 413.28□□□□□ -0.284e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PLD1-216ENST00000498278 996 ntTSL 55.75□□□□□ -1.494e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PLD1-204ENST00000418087 621 ntTSL 45□□□□□ -1.614e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FARP1-237ENST00000601853 749 ntTSL 515.2■□□□□ 0.025e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FARP1-215ENST00000595817 778 ntTSL 510.93□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FARP1-213ENST00000595380 616 ntTSL 510.63□□□□□ -0.715e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FARP1-228ENST00000600032 810 ntTSL 59.2□□□□□ -0.945e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FARP1-226ENST00000599040 555 ntTSL 59.2□□□□□ -0.945e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FARP1-217ENST00000596467 799 ntTSL 58.29□□□□□ -1.085e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-207ENST00000485250 2010 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-203ENST00000413919 1329 ntTSL 313.84□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-204ENST00000437140 1285 ntTSL 512.43□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-205ENST00000438012 1653 ntTSL 211.94□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-209ENST00000487595 623 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NUPL2-208ENST00000486136 350 ntTSL 23.69□□□□□ -1.822e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZFAND2A-204ENST00000471448 542 ntTSL 29.29□□□□□ -0.924e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZFAND2A-207ENST00000574135 433 ntTSL 37.17□□□□□ -1.264e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.787e-21■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-207ENST00000477745 697 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-216ENST00000607144 671 ntTSL 213.76□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-210ENST00000498772 946 ntTSL 212.78□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-213ENST00000584797 582 ntTSL 312.78□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 NR2F2-203ENST00000421109 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.557e-21■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-214ENST00000585034 1345 ntTSL 210.76□□□□□ -0.693e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PIGL-206ENST00000470116 550 ntTSL 510.41□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.24□□□□□ -0.773e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PRPSAP1-209ENST00000494662 572 ntTSL 26.32□□□□□ -1.43e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 55.77□□□□□ -1.493e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.636e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.229e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AUH-205ENST00000478465 751 ntTSL 320.75■□□□□ 0.918e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.849e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 414.72□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 514□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 513.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AUH-204ENST00000475023 641 ntTSL 29.12□□□□□ -0.958e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 POM121C-201ENST00000398379 715 ntTSL 28.52□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 21.5
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