Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms