Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GTF3C1Q12789 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GTF3C1Q12789 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GTF3C1Q12789 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GTF3C1Q12789 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GTF3C1Q12789 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GTF3C1Q12789 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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