Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 IMP4YNL075W 873 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RFC3YNL290W 1023 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YPR136CYPR136C 513 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SUS1YBR111W-A 291 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 APD1YBR151W 951 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SHQ1YIL104C 1524 nt3.59□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 AEP1YMR064W 1557 nt3.59□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 VPS45YGL095C 1734 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RNR1YER070W 2667 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 BUD5YCR038C 1929 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 FAD1YDL045C 921 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SOP4YJL192C 705 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 IES3YLR052W 753 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RPL22AYLR061W 366 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 BUR2YLR226W 1188 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RPN13YLR421C 471 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YNL235CYNL235C 432 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RBL2YOR265W 321 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 FRM2YCL026C-A 582 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SIN4YNL236W 2925 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 STP1YDR463W 1560 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 PRM15YMR278W 1869 nt3.58□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YDL016CYDL016C 303 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 DUN1YDL101C 1542 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SLD5YDR489W 885 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 PSP1YDR505C 2526 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YGL159WYGL159W 1113 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 LRP1YHR081W 555 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 AIM22YJL046W 1230 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 ILM1YJR118C 612 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 NNT1YLR285W 786 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 DDP1YOR163W 567 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YPR170CYPR170C 336 nt3.57□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 IOC2YLR095C 2439 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 NOP12YOL041C 1380 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RPS29BYDL061C 171 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RPS13YDR064W 456 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YDR193WYDR193W 399 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 CGR1YGL029W 363 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YIL029CYIL029C 429 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 PAM18YLR008C 507 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YNL122CYNL122C 348 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YPL205CYPL205C 345 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SHG1YBR258C 429 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 TSR1YDL060W 2367 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 JJJ1YNL227C 1773 nt3.56□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 VID27YNL212W 2349 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RRN7YJL025W 1545 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 NUP85YJR042W 2235 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RIM4YHL024W 2142 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 FUS2YMR232W 2034 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 MXR1YER042W 555 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SEC53YFL045C 765 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 EAF6YJR082C 342 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YKL069WYKL069W 543 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YOR169CYOR169C 465 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 CMD1YBR109C 444 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RAD26YJR035W 3258 nt3.55□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 snR68snR68 136 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 FIN1YDR130C 876 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YET1YKL065C 621 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 UBX4YMR067C 1251 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 PAI3YMR174C 207 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 TOA1YOR194C 861 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SPT6YGR116W 4356 nt3.54□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YDR526CYDR526C 471 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 YFL015CYFL015C 495 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 SAE2YGL175C 1038 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 CIC1YHR052W 1131 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 FYV7YLR068W 456 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 RIM11YMR139W 1113 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 DPB3YBR278W 606 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 ASI1YMR119W 1875 nt3.53□□□□□ -1.84
LCB4Q12246 MNT4YNR059W 1743 nt3.53□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 MIP6YHR015W 1980 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RSC1YGR056W 2787 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 ISM1YPL040C 3009 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 EBS1YDR206W 2655 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 HLR1YDR528W 1272 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YGR042WYGR042W 816 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 UPF3YGR072W 1164 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SDL1YIL167W 633 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YJL007CYJL007C 315 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 ECM4YKR076W 1113 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YPT7YML001W 627 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 MSN1YOL116W 1149 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SPR3YGR059W 1539 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 VPS30YPL120W 1674 nt3.52□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 LCB5YLR260W 2064 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PMT6YGR199W 2280 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YPR003CYPR003C 2265 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 NCB2YDR397C 441 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.51□□□□□ -1.85
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