Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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