Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNL1Q0VF96 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms