Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFFO1Q0D2I5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms