Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUDPQ08623 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms