Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FMODQ06828 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FMODQ06828 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FMODQ06828 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FMODQ06828 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FMODQ06828 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FMODQ06828 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms