Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN11Q06124 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms