Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6Q03468 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6Q03468 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms