Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP27A1Q02318 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms