Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPEQ02224 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms