Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF17Q02223 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms