Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F1Q01094 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F1Q01094 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms