Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms