Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms