Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HPCAP84074 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HPCAP84074 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HPCAP84074 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPCAP84074 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPCAP84074 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPCAP84074 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPCAP84074 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPCAP84074 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPCAP84074 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPCAP84074 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms