Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX1P78337 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX1P78337 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX1P78337 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITX1P78337 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX1P78337 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX1P78337 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms