Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HBBP68871 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBBP68871 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBBP68871 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBBP68871 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms