Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms