Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms