Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTBP60709 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTBP60709 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTBP60709 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms