Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCD1P59942 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms