Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3S2P59780 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms