Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME5P56597 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME5P56597 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME5P56597 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME5P56597 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME5P56597 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME5P56597 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME5P56597 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME5P56597 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME5P56597 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms