Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH8P55286 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH8P55286 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH8P55286 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH8P55286 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH8P55286 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH8P55286 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms