Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L1P55209 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L1P55209 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms