Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF1P55201 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms