Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF10P55107 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF10P55107 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF10P55107 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF10P55107 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF10P55107 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF10P55107 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF10P55107 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF10P55107 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDF10P55107 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDF10P55107 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF10P55107 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF10P55107 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms