Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHBP55084 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHBP55084 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHBP55084 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHBP55084 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHBP55084 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHBP55084 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms