Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms