Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATN1P54259 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATN1P54259 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATN1P54259 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATN1P54259 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATN1P54259 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATN1P54259 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATN1P54259 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATN1P54259 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATN1P54259 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms