Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms